Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc17E9PVB5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttc17E9PVB5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc17E9PVB5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms