Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ26

Kctd18, Potassium channel tetramerisation domain containing 18, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd18E0CZ26 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd18E0CZ26 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kctd18E0CZ26 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kctd18E0CZ26 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms