Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd1D3YXK1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samd1D3YXK1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms