Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn24D3YXJ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn24D3YXJ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn24D3YXJ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms