Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia4B8QI36 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia4B8QI36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfia4B8QI36 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia4B8QI36 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms