Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcb5B5X0E4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb5B5X0E4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb5B5X0E4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms