Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rd3lB2RV38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rd3lB2RV38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms