Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf3B2RQG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf3B2RQG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms