Protein–RNA interactions for Protein: A6X8I0

Gm1993, Predicted gene 1993, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1993A6X8I0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm1993A6X8I0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm1993A6X8I0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1993A6X8I0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm1993A6X8I0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm1993A6X8I0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm1993A6X8I0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm1993A6X8I0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms