Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931406B18RikA2RSL7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931406B18RikA2RSL7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931406B18RikA2RSL7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms