Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Btbd35f28A2CFD5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Btbd35f28A2CFD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Btbd35f28A2CFD5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Btbd35f28A2CFD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Btbd35f28A2CFD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms