Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn3aA2ASI5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn3aA2ASI5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn3aA2ASI5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms