Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm12A2AJ77 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm12A2AJ77 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm12A2AJ77 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms