Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbbp8nlA2ABX0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rbbp8nlA2ABX0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms