Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms