Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSG3

Gm28269, MCG1047152, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28269A0A087WSG3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15,44■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,43■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15,41■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Gm28269A0A087WSG3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,33■□□□□ 0,05
Gm28269A0A087WSG3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15,32■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Gm28269A0A087WSG3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms