Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms