Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700017N19RikA0A087WPJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms