Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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