Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms