Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms