Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms