Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpcn1Q9EQJ0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpcn1Q9EQJ0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpcn1Q9EQJ0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpcn1Q9EQJ0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms