Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms