Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clca1Q9D7Z6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clca1Q9D7Z6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Clca1Q9D7Z6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clca1Q9D7Z6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clca1Q9D7Z6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clca1Q9D7Z6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clca1Q9D7Z6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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