Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms