Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms