Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms