Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms