Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msantd4Q91YU3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msantd4Q91YU3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms