Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraipQ8VIG6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms