Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms