Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms