Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms