Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms