Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms