Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Syne3Q4FZC9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Syne3Q4FZC9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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