Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms