Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Kdm4dQ3U2K5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms