Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms