Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs2Q03350 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms