Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms