Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad50P70388 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad50P70388 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms