Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms