Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VtnP29788 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VtnP29788 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VtnP29788 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VtnP29788 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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