Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsta3P23591 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms