Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prim1P20664 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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