Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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