Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29094F6Q785 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29094F6Q785 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms