Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd1E9Q3H4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms